服务介绍
Small RNA 深度测序
Small RNA是一类长度在20~30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等。Small RNA能够调控基因的表达,在细胞的生长、发育、代谢等基础生物学过程中扮演着重要的角色,甚至在癌症等相关疾病形成过程中起着关键的作用。第二代高通量测序技术省去了烦琐的Small RNA克隆文库构建过程,可以一次性产生上百万条Small RNA序列,能够快速鉴定特定条件下表达的已知Small RNA并发现新的Small RNA,同时还可以研究不同条件下Small RNA的表达差异,并可以联合表达谱数据进行关联分析。
本公司拥有标准化操作实验室、高通量测序技术平台、经验丰富的技术人员和专业的生物信息团队和大型计算机,实验周期短,质量可靠。可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。同时也可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。
服务内容
1. 原始数据处理;
2. 数据去杂;
3. 已知miRNA的注释;
4. 新miRNA的预测;
5. miRNA靶基因的预测;
6. miRNA表达量统计;
7. miRNA表达差异分析(不少于两个样品);
8. miRNA表达模式聚类分析;
9. miRNA与表达谱数据关联分析;
10.表达差异miRNA靶基因GO富集分析;
11.差异表达miRNA靶基因Pathway富集分析;
12.差异表达miRNA靶基因蛋白互作网络分析。
服务说明
1.组织样品:
1). 动物组织:>2g;
2). 植物组织:>4g;
3). 细胞培养:>1*107个;
4). 血液样品:≥2ml。
2.RNA样品:
1). 请提供浓度≥ 200ng/μL,总量≥10μg的RNA(单次建库用量为5μg);
2) .OD260/280介于1.8~2.2之间,OD260/230≥2.0,RIN≥6.5,28S:18S≥1.0,确保RNA无降解;
3). 送样时请标记清楚样品编号,管口使用Parafilm膜密封;
4). 样品保存期间切忌反复冻融;
5). 送样时请使用干冰运输。
3.cDNA样品:
1). 样品需求量(单次): 建议送样量≥2ug,对于总量≥500ng的样本可以采用风险建库;
2). 样品浓度: 低10 ng/ul;
3). 样品纯度:OD260/280=1.80-2.00,RIN≥6.5;
4). 样品保存期间切忌反复冻融,送样时请使用干冰运输。
4. 项目运转周期:标准流程的运转周期为约40个工作日;
5. 若另有疑问欢迎向本公司咨询,我们将竭诚为您服务。
质量承诺
1.准确可靠的 Small RNA 深度测序结果;
2.专业权威的Small RNA 深度测序分析报告;
3.真实的原始实验数据;
4.详细的实验步骤。